Substancje używane do diagnozowania chorób pacjentów, studiowania stanów chorobowych. Wiele problemów zdrowotnych znajduje odzwierciedlenie w nieprawidłowej chemii organizmu. Poprzez badanie płynów ustrojowych (krwi, moczu, płynu mózgowo-rdzeniowego) można określić jak biochemia ciała uległa zmianie, co pozwala na postawienie diagnozy. Przykładem może być wysoki poziom glukozy we krwi, który wskazuje na możliwość wystąpienia cukrzycy.